Institute of Computer Science Pattern Recognition and Bioinformatics

Stefan Posch: Lehre

Algorithmen der Bioinformatik I - Übungen

• Serie 1 (Abgabe bis spätestens 14. April, 12 Uhr):
  • Übungsblatt 1 (pdf)
  • orchid.dna
• Serie 2 (Abgabe am 21. April)
  • Übungsblatt 2 (pdf)
• Serie 3 (Abgabe am 28. April)
  • Übungsblatt 3 (pdf)
  • E. coli Sequenz (4.6 MB), als gzip (1.4 MB)
• Serie 4 (Abgabe am 05. Mai, Abgabe verlängert bis So, 07. Mai)
  • Übungsblatt 4 (pdf)
  • Text über einem Alphabet von 40 Zeichen
  • Text über einem Alphabet von 80 Zeichen
  • neuer Text mit "lesbaren" Zeichen über Alphabet der Länge 40
  • neuer Text mit "lesbaren" Zeichen über Alphabet der Länge 80
  • Musterlösungen:
    • Algorithmen bis Übung 4 (Java, 7 kB)
    • Plots fuer Vergleichs- und Zeitmessung für Alphabete der Größe 4, 20, 40, 80 (tar.gz, 610 kB)
• Serie 5 (Abgabe am 12. Mai)
  • Übungsblatt 5 (pdf)
• Serie 6 (Abgabe am 19. Mai)
  • Übungsblatt 6 (pdf)
• Serie 7 (Abgabe am 26. Mai)
  • Übungsblatt 7 (pdf)
• Serie 8 (Abgabe am 2.6.06)
  • Übungsblatt 8 (pdf)
• Serie 9 (Abgabe am 9. Juni)
  • Übungsblatt 9 (pdf)
• Serie 10 (Abgabe am 16. Juni)
  • Übungsblatt 10 (pdf)
  Serie 11 (Abgabe am 23. Juni)
  • Übungsblatt 11 (pdf)
• Serie 12 (Abgabe am 30. Juni)
  • Übungsblatt 12 (pdf)
• Serie 13 (Abgabe am 7. Juli)
  • Übungsblatt 13 (pdf)